В настоящее время военных врачей обучают в Военном институте Сил воздушной обороны и Западно-Казахстанском медицинском университете в Актобе. Подготовка военно-медицинских кадров послевузовского образования проходит в Национальном университете обороны РК совместно с Медицинским университетом «Астана». Также специалисты готовятся за границей в России, Узбекистане, Армении, Китае и Турции, что связано с языковыми и культурными барьерами и признанием дипломов.
Проект включает реорганизацию существующих учреждений, создание новой инфраструктуры, разработку образовательных программ и получение лицензии. Центр военной медицины МО РК в Алматы станет основой нового учебного заведения. Работы ведутся с участием оборонного ведомства, министерств здравоохранения и науки, Казахстанско-Российского медицинского университета и общественных организаций.