Ержан Булегенов родился в 1978 году в Южно-Казахстанской области. Окончил юридический факультет Алматинского государственного национального университета имени Абая.
Трудовую деятельность начал в 2000 году в органах прокуратуры Астаны, затем работал в транспортной прокуратуре. С 2003 года занимал различные должности в Генеральной прокуратуре, с 2006 года возглавлял отдел прокуратуры Астаны. В 2009 году назначен прокурором Есильского района столицы.
В разные годы занимал посты прокурора Кокшетау, Павлодара, заместителя прокурора Южно-Казахстанской и Туркестанской областей. С марта 2021 года возглавлял ДЭР по Костанайской области.
Ранее сообщалось, что руководителем департамента экономических расследований ВКО назначен Арман Жунусов.