Айдын Кульсеитов родился в Усть-Каменогорске. Окончил Восточно-Казахстанский государственный технический университет по специальности «Инженер-экономист» и Академию государственной службы при Президенте РК по специальности «Менеджер государственной службы».
Трудовую деятельность начал в частной сфере, дойдя до руководящих должностей. Затем перешел на государственную службу. Работал в Министерстве индустрии и торговли, Министерстве энергетики и минеральных ресурсов, был председателем правления АО «Национальное агентство по технологическому развитию», АО «Казахстанский институт развития индустрии».
С 2017 года занимал ряд руководящих должностей в Администрации Президента РК.
В течение двух лет возглавлял Центр стратегических разработок и анализа Администрации Президента РК. Затем был назначен заведующим Отделом стратегического планирования Администрации Президента Республики Казахстан.
В последние два года работал руководителем Отдела социально-экономического мониторинга Администрации Президента РК.
Ранее распоряжением Главы государства Айдын Кульсеитов освобожден от должности заведующего Отделом социально-экономической политики Администрации Президента РК.